基因组——了解新型冠状病毒的最直接手段

doi:10.3969/j.issn.2095-3755.2020.01.005

结核病与肺部健康杂志 ›› 2020, Vol. 9 ›› Issue (1): 16-18.doi: 10.3969/j.issn.2095-3755.2020.01.005

基因组——了解新型冠状病毒的最直接手段

刘翟()

430071 中国科学院武汉病毒研究所微生物资源与生物信息研究中心

收稿日期:2020-03-18 出版日期:2020-03-30 发布日期:2020-04-17
通信作者: 刘翟 E-mail:liud@wh.iov.cn

Virus genome, the direct way to know the SARS-CoV-2 virus

LIU Di()

Cen ter for Virus and Bacteria Resources and Bioinformation, Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan 430071, China

Received:2020-03-18 Online:2020-03-30 Published:2020-04-17
Contact: LIU Di E-mail:liud@wh.iov.cn

摘要/Abstract

摘要：

2020年3月11日WHO宣布新型冠状病毒肺炎为“全球流行病”。理解新型冠状病毒基因组,阐明深藏在病毒背后的科学问题,将为控制疫情传播提供重要的科学依据。作者阐述了解析病毒基因组能够有助于进行病原鉴定、基因分析、病毒溯源、传播动态、疫情预判等重要工作,同时也提出了目前新型冠状病毒病毒基因组研究的重点方向,以及加强国内外交流的重要意义。

关键词: 冠状病毒感染, 基因, 高通量核苷酸测序

Abstract:

WHO announced the COVID-19 epidemic as a global pandemic on 11 March 2020. Understanding the genome of the pathogen SARS-CoV-2 virus, and unravelling the science behind the virus will pave the way for controlling the disease. This manuscript summarized the aspects that virus genome could contribute to, including virus identification, essential gene analysis, virus origination, transmission dynamics, and epidemic prediction. Meanwhile, key directions of SARS-CoV-2 virus genomics in the current stage, and the importance of communication and collaboration are stated.

Key words: Coronavirus Infections, Genes, High-Throughput Nucleotide Sequencing

刘翟. 基因组——了解新型冠状病毒的最直接手段[J]. 结核病与肺部健康杂志, 2020, 9(1): 16-18. doi: 10.3969/j.issn.2095-3755.2020.01.005

LIU Di. Virus genome, the direct way to know the SARS-CoV-2 virus[J]. Journal of Tuberculosis and Lung Health, 2020, 9(1): 16-18. doi: 10.3969/j.issn.2095-3755.2020.01.005

参考文献 8

[1]	肖和平, 刘一典 . 新型冠状病毒疫情防控机制对结核病防治的启示. 中国防痨杂志, 2020,42(4):312-316.
[2]	Lu R, Zhao X, Li J , et al. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. Lancet, 2020,395(10224):565-574.
[3]	Xu X, Chen P, Wang J , et al. Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission. Sci China Life Sci, 2020,63(3):457-460.
[4]	Wrapp D, Wang N, Corbett KS , et al. Cryo-EM structure of the 2019-nCoV spike in the prefusion conformation. Science, 2020,367(6483):1260-1263.
[5]	Zhou P, Yang XL, Wang XG , et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature, 2020,579(7798):270-273.
[6]	Dudas G, Carvalho LM, Bedford T , et al. Virus genomes reveal factors that spread and sustained the Ebola epidemic. Nature, 2017,544(7650):309-315.
[7]	Ni M, Chen C, Qian J , et al. Intra-host dynamics of Ebola virus during 2014. Nat Microbiol, 2016,1(11):16151
[8]	Guan Y, Zheng BJ, He YQ , et al. Isolation and characterization of viruses related to the SARS coronavirus from animals in southern China. Science, 2003,302(5643):276-278.

[1]	翟鹏勇, 张潇雅, 马文途, 苏凝, 赵素霞. 新型冠状病毒感染肺部影像学病灶延迟吸收相关因素分析[J]. 结核与肺部疾病杂志, 2024, 5(S): 30-34.
[2]	何繁漪, 陆霓虹, 杜映荣. 结核病与COVID-19相互作用的研究进展[J]. 结核与肺部疾病杂志, 2024, 5(4): 345-351.
[3]	苏醒岳, 王蓓蕾, 马香. 中国儿童2型炎症型哮喘单核苷酸多态性和相关基因关系的研究进展[J]. 结核与肺部疾病杂志, 2024, 5(4): 370-375.
[4]	徐思芸, 陆霓虹. 新型冠状病毒感染致呼吸系统损伤的研究进展[J]. 结核与肺部疾病杂志, 2024, 5(3): 267-272.
[5]	袁永龙, 李慧梅, 马德东. 宏基因组二代测序辅助诊断鹦鹉热一例并文献复习[J]. 结核与肺部疾病杂志, 2024, 5(2): 113-119.
[6]	张洁, 丁北川, 任怡宣, 田丽丽, 易俊莉, 庞梦迪, 杨新宇. 基于基因分型探讨北京市结核病患者复发原因及菌株遗传特征[J]. 结核与肺部疾病杂志, 2024, 5(2): 128-134.
[7]	姚晓伟, 刘树仁, 景艳色, 贾晨光. 二代测序技术在骨关节结核临床诊断中的应用价值[J]. 结核与肺部疾病杂志, 2024, 5(1): 37-43.
[8]	林荣梅, 陆霓虹. 新型冠状病毒感染相关心肌损伤研究现状[J]. 结核与肺部疾病杂志, 2023, 4(6): 493-498.
[9]	龚亚波, 刘礼亲, 徐祖辉, 杨渊. 新型冠状病毒感染疫情对湖南省结核病定点医院医疗服务的影响研究[J]. 结核与肺部疾病杂志, 2023, 4(4): 277-282.
[10]	周永芳, 付江泉, 董文涛, 房东海, 胡晓纯. 吸入一氧化氮治疗重及危重型新型冠状病毒感染的疗效与安全性的Meta分析[J]. 结核与肺部疾病杂志, 2023, 4(1): 33-40.
[11]	任阳, 沈一丹, 王梅, 王雷, 李锋. 高通量测序诊断鹦鹉热衣原体肺炎六例并文献复习[J]. 结核与肺部疾病杂志, 2022, 3(6): 526-530.
[12]	周明, 刘皇容, 唐柳生, 刘桑, 刘爱梅. 结核分枝杆菌对德拉马尼耐药及其分子机制研究进展[J]. 结核与肺部疾病杂志, 2022, 3(2): 153-157.
[13]	吴迪, 林芬, 陈晓红, 林友飞, 黄明翔, 陈力舟. 恢复期血浆治疗快速进展重型新型冠状病毒肺炎二例并文献复习[J]. 结核与肺部疾病杂志, 2022, 3(1): 33-43.
[14]	吴迪, 范欣欣, 沈建山, 林友飞, 陈晓红, 黄明翔, 陈力舟. 联合检测凝血筛查指标及D-二聚体对新型冠状病毒肺炎患者临床分型的诊断价值[J]. 结核与肺部疾病杂志, 2021, 2(4): 355-360.
[15]	刘新宇, 张倩, 孙倩. 北京市昌平区耐多药结核分枝杆菌对新抗结核药品的耐药情况分析[J]. 结核与肺部疾病杂志, 2021, 2(2): 169-173.

基因组——了解新型冠状病毒的最直接手段

Virus genome, the direct way to know the SARS-CoV-2 virus

RichHTML

PDF (PC)

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献 8

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

友情链接